Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx21Q3UR97 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx21Q3UR97 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx21Q3UR97 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms