Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd9Q3UQU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd9Q3UQU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd9Q3UQU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd9Q3UQU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms