Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm20Q3UQS8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm20Q3UQS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm20Q3UQS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms