Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms