Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrc4Q3UP24 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrc4Q3UP24 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms