Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog7Q3UM29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog7Q3UM29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms