Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp19Q3UJD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms