Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef1Q3UHC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef1Q3UHC1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef1Q3UHC1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgef1Q3UHC1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms