Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tnrc6cQ3UHC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnrc6cQ3UHC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6cQ3UHC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms