Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc177Q3UHB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc177Q3UHB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms