Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mcrip1Q3UGS4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mcrip1Q3UGS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms