Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip13Q3UA06 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trip13Q3UA06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip13Q3UA06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms