Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LbrQ3U9G9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LbrQ3U9G9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LbrQ3U9G9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LbrQ3U9G9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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