Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rnf40Q3U319 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rnf40Q3U319 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rnf40Q3U319 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rnf40Q3U319 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf40Q3U319 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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