Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem35bQ3U0Y2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem35bQ3U0Y2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms