Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KhsrpQ3U0V1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KhsrpQ3U0V1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms