Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt1Q3TX08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt1Q3TX08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt1Q3TX08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt1Q3TX08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms