Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw18Q3TSA9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw18Q3TSA9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms