Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q3TQQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3TQQ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms