Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XylbQ3TNA1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XylbQ3TNA1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms