Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp444Q3TDV8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Zfp444Q3TDV8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp444Q3TDV8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms