Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V1rd19Q3KNP5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
V1rd19Q3KNP5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms