Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3KNL4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms