Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1lQ3B807 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1lQ3B807 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms