Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrna5Q2MKA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms