Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc162pQ0VG85 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms