Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne7Q0VE82 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cpne7Q0VE82 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne7Q0VE82 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms