Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal1Q0VBP7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal1Q0VBP7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms