Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt80Q0VBK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt80Q0VBK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms