Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ttc21bQ0HA38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms