Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf541Q0GGX2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf541Q0GGX2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf541Q0GGX2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms