Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700061G19RikQ08EE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
1700061G19RikQ08EE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700061G19RikQ08EE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms