Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssrp1Q08943 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssrp1Q08943 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssrp1Q08943 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms