Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnma1Q08460 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnma1Q08460 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms