Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata4Q08369 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms