Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn2Q08093 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms