Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou6f1Q07916 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou6f1Q07916 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou6f1Q07916 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou6f1Q07916 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou6f1Q07916 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pou6f1Q07916 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou6f1Q07916 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms