Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf3Q07104 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf3Q07104 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms