Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1bQ06985 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1bQ06985 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms