Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox4Q06831 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox4Q06831 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms