Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rcn1Q05186 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rcn1Q05186 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms