Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox12Q04890 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox12Q04890 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms