Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox9Q04887 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox9Q04887 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox9Q04887 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox9Q04887 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sox9Q04887 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox9Q04887 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms