Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms