Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk16Q04735 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdk16Q04735 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk16Q04735 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms