Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd1Q04519 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd1Q04519 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms