Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Runx1Q03347 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms