Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hivep1Q03172 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hivep1Q03172 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms