Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col6a2Q02788 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col6a2Q02788 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col6a2Q02788 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms