Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfiaQ02780 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfiaQ02780 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms