Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec23aQ01405 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms